Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pnpla6Q3TRM4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pnpla6Q3TRM4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.5 ms