Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms