Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sppl2bQ3TD49 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl2bQ3TD49 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms