Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc69Q3TCJ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc69Q3TCJ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms