Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa26Q3L180 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa26Q3L180 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms