Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vax1Q2NKI2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vax1Q2NKI2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms