Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam178bQ24JP3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam178bQ24JP3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam178bQ24JP3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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