Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptcd3Q14C51 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptcd3Q14C51 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptcd3Q14C51 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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