Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Perm1Q149B8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Perm1Q149B8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
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