Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc162pQ0VG85 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms