Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG49

Uncharacterized protein C15orf61 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q0VG49 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q0VG49 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q0VG49 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q0VG49 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q0VG49 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q0VG49 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q0VG49 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q0VG49 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q0VG49 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q0VG49 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q0VG49 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q0VG49 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q0VG49 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q0VG49 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q0VG49 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q0VG49 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q0VG49 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q0VG49 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q0VG49 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q0VG49 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q0VG49 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q0VG49 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q0VG49 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q0VG49 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q0VG49 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q0VG49 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q0VG49 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q0VG49 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q0VG49 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q0VG49 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q0VG49 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q0VG49 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q0VG49 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q0VG49 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q0VG49 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q0VG49 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q0VG49 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q0VG49 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q0VG49 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q0VG49 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q0VG49 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q0VG49 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q0VG49 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q0VG49 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q0VG49 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q0VG49 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q0VG49 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q0VG49 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q0VG49 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q0VG49 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q0VG49 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q0VG49 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q0VG49 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q0VG49 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q0VG49 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q0VG49 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q0VG49 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q0VG49 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q0VG49 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q0VG49 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q0VG49 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q0VG49 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q0VG49 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q0VG49 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q0VG49 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q0VG49 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q0VG49 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q0VG49 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q0VG49 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q0VG49 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q0VG49 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms