Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal1Q0VBP7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms