Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hif3aQ0VBL6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms