Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Znf541Q0GGX2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Znf541Q0GGX2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf541Q0GGX2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms