Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700061G19RikQ08EE8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.32■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.32■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms