Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc4Q08624 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc4Q08624 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms