Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata4Q08369 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata4Q08369 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms