Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn1Q08091 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms