Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Siah1bQ06985 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms