Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox13Q04891 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox13Q04891 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms