Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox9Q04887 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms