Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox8Q04886 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms