Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk16Q04735 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms