Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms