Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tff2Q03404 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms