Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl7Q03366 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms