Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk7Q03147 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk7Q03147 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms