Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col6a2Q02788 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col6a2Q02788 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col6a2Q02788 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms