Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Zfp39Q02525 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp39Q02525 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp39Q02525 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms