Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdcd1Q02242 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd1Q02242 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms