Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1cQ01815 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms