Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp1Q01514 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms