Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gja5Q01231 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gja5Q01231 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gja5Q01231 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gja5Q01231 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gja5Q01231 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms