Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Grin2bQ01097 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Grin2bQ01097 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Grin2bQ01097 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms