Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbp1Q00915 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbp1Q00915 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbp1Q00915 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms