Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GabpaQ00422 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms