Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax8Q00288 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms