Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PgrQ00175 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PgrQ00175 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PgrQ00175 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PgrQ00175 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PgrQ00175 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PgrQ00175 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PgrQ00175 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PgrQ00175 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms