Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psmb4P99026 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psmb4P99026 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psmb4P99026 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psmb4P99026 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb4P99026 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb4P99026 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Psmb4P99026 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Psmb4P99026 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb4P99026 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb4P99026 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb4P99026 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms