Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp11aP98197 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp11aP98197 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp11aP98197 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms