Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nbr1P97432 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nbr1P97432 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nbr1P97432 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms