Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll3P85442 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vgll3P85442 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms