Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb2P81069 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabpb2P81069 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms