Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx3P81067 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx3P81067 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx3P81067 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irx3P81067 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx3P81067 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx3P81067 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irx3P81067 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Irx3P81067 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx3P81067 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx3P81067 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms