Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx2P81066 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx2P81066 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx2P81066 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx2P81066 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx2P81066 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx2P81066 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx2P81066 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx2P81066 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx2P81066 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx2P81066 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms