Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Otx2P80206 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otx2P80206 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otx2P80206 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otx2P80206 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otx2P80206 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otx2P80206 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otx2P80206 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otx2P80206 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otx2P80206 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otx2P80206 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otx2P80206 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms