Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad50P70388 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad50P70388 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad50P70388 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad50P70388 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad50P70388 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad50P70388 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rad50P70388 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rad50P70388 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad50P70388 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms