Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd13P70217 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd13P70217 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms