Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf5P70191 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf5P70191 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf5P70191 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf5P70191 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf5P70191 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf5P70191 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf5P70191 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf5P70191 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf5P70191 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf5P70191 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf5P70191 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf5P70191 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf5P70191 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf5P70191 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf5P70191 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms