Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SbdsP70122 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SbdsP70122 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SbdsP70122 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SbdsP70122 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SbdsP70122 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SbdsP70122 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms